Die Generaldirektion Wasserstraßen und Schifffahrt, kurz GDWS, ist eine zentrale Behörde innerhalb der Wasserstraßen- und Schifffahrtsverwaltung des Bundes.
Sie bündelt überregionale Steuerungs-, Fach- und Vollzugsaufgaben und steht organisatorisch über den regional zuständigen Wasserstraßen- und Schifffahrtsämtern. Für Unternehmen der Schifffahrt und Logistik wird die praktische Zuständigkeit häufig dennoch beim jeweiligen WSA liegen.
Abgrenzung: GDWS ist nicht dasselbe wie das örtlich zuständige WSA.